En los Barracones, Ben está empujando a Alex en el columpio, cuando se les acerca Richard. Richard informa a Ben de que el submarino está a punto de partir, pero que no es necesario que Ben asista a la despedida de sus pasajeros. Sin embargo, Ben cree que debe ir, y se encamina al embarcadero, donde un Widmore con las manos esposadas está siendo llevado al submarino. Ben le habla, y Widmore comenta que sólo ha venido a "mofarse" por haber conseguido exiliarle. Widmore ha sido exiliado por "romper las reglas" es decir, por haber salido de la Isla con regularidad, y por tener una familia fuera de ella (específicamente, por tener una "hija con una extraña"). Widmore le dice con desdeño a Ben que algún día él tendrá que elegir entre Alex y la Isla. Entonces es metido en el submarino, y se marcha para siempre.
2008
Después de dejar a Jack y a los demás en Los Angeles, Ben camina por un muelle y llama por teléfono a Charles Widmore, informándole que regresara a la Isla, pero que antes va a matar a Penny, quien en ese momento se encuentra en un bote en el muelle. Mientras se acerca para hacerlo, se topa con Desmond, sacando la compra del coche. Cuando le pregunta a Ben qué está haciendo allí, Ben le dispara, pero no lo mata, tirando a Desmond al suelo. Ben sigue avanzando hasta el barco, donde apunta a Penny con su arma, explicando que el padre de ella asesinó a su hija. Penny mantiene que ella no tiene ninguna relación con su padre, pero Ben se dispone a dispararla, hasta que ve al hijo de Desmond, Charlie. Ben baja el arma, y entonces es derribado por Desmond, que le propina una severa paliza y a continuación lo tira al agua del puerto.
Tiempo real
Ben despierta y se encuentra cara a cara con Locke. Ben se muestra sorprendido de ver vivo a Locke, pero le dice que se esperaba esa resurrección. También le dice a Locke que ha roto las reglas y que por ello debe sufrir las consecuencias, que resultarán en Ben siendo juzgado por el Monstruo. Ben va a la playa, donde varios supervivientes, incluyendo Bram e Ilana, están intentando cargar con un contenedor del que dicen contiene provisiones necesarias. Ben habla de Locke con Caesar, contándole que no cree que Locke estuviera en el avión. Ben finge ignorancia cuando Caesar le informa de que Locke dijo que Ben le había matado, y sugiere que Locke puede estar loco y ser peligroso. Caesar le dice que él le defenderá, y le muestra la escopeta que obtuvo en la oficina de La Hidra. Más tarde, en dicha oficina, Ben rebusca en el escritorio. Cuando encuentra una fotografía de él y Alex en tiempos más felices, se la mete en el bolsillo, justo cuando Locke entra en la sala. Locke exige hablar con Ben por haberle matado. Ben replica que esa era la única forma de traerle de vuelta, así como al resto, además de que tenía información vital sobre cómo volver. Locke dice entonces que quiere una disculpa, pero va más allá y dice que ayudará a Ben en su enfrentamiento con el Monstruo.
Ben y Locke se preparan para tomar una de las canoas, para ir a la isla principal y que así Ben sea "juzgado" por el Monstruo. De repente, Caesar aparece junto a tres supervivientes, que se enfretan a ambos. Caesar se cofirma como líder, y prohíbe que las canoas vayan a ninguna parte. Locke no quiere escucharle, y Caesar intenta coger su escopeta, pero ya no la lleva. Ben es quien la tiene ahora, y dispara a un desarmado Caesar en el pecho, asesinandolo. Luego dice a los otros tres supervivientes que se vayan. Ben le dice a John que considere esto una disculpa por matarlo. Luego zarpan hacia la isla principal.
Al llegar, descansan un momento en el embarcadero, y Locke comenta que cree que Ben sólo busca perdón por la muerte de Alex. Ben no confirma ni niega esto. Al llegar a los Barracones, ven la silueta de una figura en la ventana del antiguo cuarto de Alex. Tras investigar, Ben descubre que se trata de Sun. Frank tambiéne stá en la casa, y le explican a Ben que un hombre llamado Christian les dijo que esperaran allí a John Locke, descubriendo que este se encuentra afuera, vivo. Sun enseña a Ben la fotografía de los reclutas DHARMA de 1977, y se sorprende al descubrir que Ben no sabía que sus amigos habían estado en la Iniciativa DHARMA.
Frank advierte a Sun del peligro de escuhar a un muerto y a un asesino, pero Sun afirma que les seguirá si existe una posibilidad de que Jin siga vivo. Ben se mete en su sala secreta oculta detrás de la librería, y entra en un túnel antiguo hasta llegar a una oquedad en la roca. Allí hay un charco de agua, y Ben tira de un mecanismo, drenando todo el agua. Habiendo invocado al Monstruo, le susurra al agujero, "Estaré afuera." Luego sale al exterior a esperar. Allí está Sun, y entonces Ben le comenta que no sabía que Locke resucitaría; había visto a la Isla obrar milagros, pero nunca uno como aquél. Frank se marcha para volver a Isla Hidra después de no conseguir que Sun vuelva con él.
El Monstruo no aparece, y entonces Locke propone a Ben que vayan a buscarlo. Ben dice no saber dónde vive el Monstruo, pero Locke dice que él sí. Ben y Sun siguen a Locke hasta las murallas del Templo. Locke explica que deben entrar por uno de los agujeros del suelo. Ellos lo hacen, pero Sun espera fuera. Antes de que Ben entre, le dice a Sun que, si abandona la Isla, encuentre a Desmond y le diga que lo siente.
Una vez bajo tierra, Locke y Ben encienden antorchas. Ben explica que cree que Locke tenía razón, y que busca penitencia por la muerte de Alex. Poco después, el suelo bajo Ben se hunde y este cae a un nivel inferior del Templo. Locke dice que irá a buscar algo para subir a Ben y se marcha, ignorando las peticiones de Ben de que no lo haga.
Ben avanza por las catacumbas del Templo, mirando columnas cubiertas de jeroglíficos. Al llegar a la parte central de una sala, contempla un mural antiguo con escrituras egipcias y una representación del Monstruo junto a un dios, posiblemente Anubis. En ese instante, oye los sonidos característicos del Monstruo, y con horror contempla cómo este brota de una rejilla que hay frente al mural. El Monstruo rodea a Ben, arremolínandose entorno a él. Ben contempla en el humo recuerdos de Alex y Widmore, incluyendo la muerte de Alex a manos de Martin Keamy.
Tras mostrarle estas imágenes a Ben, el Monstruo se retira, reapareciendo un momento después con la forma de Alex. Ben le pide disculpas a Alex, admitiendo tener la culpa en todo lo ocurrido, a lo que ella se muestra conforme. Pero entonces "Alex" lo empuja contra una columna, informando a Ben de que está al corriente del plan de este de volver a matar a Locke, y exige que a partir de ahora Ben sigua a Locke y reconozca su liderazgo, o de lo contrario le perseguirá y le destruirá. Ben promete hacerlo, y Alex desparece. Entonces vuelve al agujero, donde Locke ha conseguido traer una cuerda. Cuando Locke ve a Ben, le pregunta qué ha pasado, y este responde: "me ha dejado vivir".
Mientras, Frank vuelve a la Hidra en la canoa. Jed se le acerca, advirtiéndole de que Ilana y otros supervivientes tienen armas. Frank, precavido, vuelve al campamento, donde Ilana y Bram le apuntan con sus pistolas. Ilana pregunta a Frank, "¿Qué yace a la sombra de la estatua?" Cuando Frank no es capaz de responder, ella lo deja inconsciente con la culata de la pistola, y ordena a Bram que le ate y se lo lleven con ellos.
