Charlotte Lewis llegó a la isla al saltar en paracaídas de un helicóptero proveniente del carguero. Fue el último pasajero en saltar (después de Miles y Daniel) cuando el helicóptero se encontró con problemas eléctricos. Durante el descenso, su paracaídas quedó atrapado con un árbol, sobre una rivera. Intentó soltarse y logró caer al agua, poco antes de que el grupo de Locke la encontrara. Charlotte intentó indagar en los supervivientes, pero estos se mostraron reacios a dar información. Locke le hizo saber que no querían ser encontrados, por lo que le quitaron su Localizador GPS y se lo colocaron a Vincent para desorientar a sus compañeros que la buscaban. Tras ver a lo lejos una bengala disparada por su compañero Frank Lapidus, Charlotte intentó separarse del grupo, pero recibió en el pecho dos disparos por parte de Ben, que le había sustraido el arma a Karl. Afortunadamente, Charlote llevaba puesto su chaleco antibalas (que Miles le había entregado justo antes de saltar), por lo que sobrevivió a los impactos.
A causa de este altercado Locke se dispuso a ejecutar a Ben, quien para evitar su muerte adujo tener información vital sobre los miembros del carguero, y comenzó a recitar datos precisos sobre la historia de vida de Charlotte. No obstante, como ha insinuado la propia Charlotte, esta información podría no ser del todo cierta. ben también reveló que tenía un espía en el carguero. ("Confirmed Dead")
Charlotte continuó viajando con el grupo de Locke y, como ella misma le aclaró a Hurley, era básicamente una rehén. Con el resto del grupo, llegó a los Barracones. No estuvo allí durante mucho tiempo, ya que Sayid llegó y propuso cambiarla por Miles. Locke aceptó el intercambio y Charlotte volvió con Sayid adonde estaban Jack, Daniel, Frank, Desmond y Juliet. Frank le preguntó si quería volver al carguero, pero ella se negó, diciendo que tenía trabajo que hacer en la Isla. ("The Economist")
Con Jack, Juliet y Daniel, Charlotte viajó a la playa, donde conoció a los demás supervivientes. Esa noche le hizo pruebas de memoria a Daniel. Cuando éste adivinó dos de las tres cartas, Daniel sintió que no estaba haciendo progresos, al contrario de lo que pensaba Charlotte. Jack les interrumpió y les dijo que no podía contactar con el carguero. Charlotte les dijo que había otro número que se utilizaba sólo para emergencias, y Juliet le exigió que lo utilizara. Charlotte llamó y Regina contestó. Cuando Charlotte preguntó por el helicóptero, que llevaba a Sayid y Desmond, Regina les informó de que no había llegado. ("Eggtown")
Mientras Jack seguía preguntándole por el helicóptero, Charlotte seguía respondiendo que sabía lo mismo que ellos. Juliet notó que era extraño que Charlotte no estuviera preocupada. Daniel le preguntó a Charlotte si podían "contárselo", y Charlotte dejó entrever que no le hacía mucha gracia. Aún así, Daniel les explicó que la percepción del tiempo en la Isla podía no ser realista, y que el helicóptero estaba bien, y aún de camino. ("The Constant")
Esa noche, Charlotte y Daniel tomaron dos trajes bilógicos y máscaras de gas y se marcharon a la Tempestad, una estación DHARMA. Mientras descansaban para beber, un agitado Daniel le preguntó qué pasaría "si no podía hacerlo". Charlotte le aseguró que sí que podría, y justo cuando iban a reemprender la marcha, Kate se topó con ellos. Les preguntó qué hacían allí, y Charlotte mintió, inventándose que estaban buscando las cajas que habían tirado del helicóptero. Cuando Kate miró en sus bolsas y vio las máscaras de gas, Charlotte le golpeó en la cabeza con la pistola y la dejó inconsciente. ("The Other Woman")
Charlotte y Daniel llegaron a la Tempestad y empezaron a trabajar en el sistema informático para desarmar el sistema de gas venenoso instalado allí. Cuando casi habían cumplido su misión apareció Juliet, que intentó detenerlos. Hubo una pelea entre las dos, pero cuando le dijeron que no querían liberar el gas, sino inutilizarlo, Juliet cambió de opinión y les dejó que siguieran. Cuando ya salían de la estación llegó Kate y apuntó a Charlotte con el arma. Charlotte le dijo que acababan de salvar la vida a todos los de la Isla, y llevó a Kate adentro para explicarle lo que había pasado. ("The Other Woman") La mañana siguiente fue vista desayunando en el campamento de la playa. ("Ji Yeon")
Charlotte estaba presente en la playa cuando el cuerpo de Ray apareció en la orilla de la playa. Cuando Jack le preguntó si sabía algo ella respondió que no. Más adelante, Daniel reveló que nunca fue su objetivo rescatar a los supervivientes del vuelo 815. ("The Shape of Things to Come") Al día siguiente ella y Daniel seguían discutiendo con los supervivientes, sobre todo con Bernard y Rose, sobre lo que realmente sabían sobre el carguero. La discusión fue interrumpida por Jack, quien necesitaba una operación para extirpar su apéndice infectado. Charlotte, junto con Daniel, Jin y Sun viajaron al Bastón para conseguir material médico para tratar a Jack. Cuando llegaron a la estación, Daniel se ofreció a entrar primero para asegurarse de que no había ningún peligro. Jin le preguntó a Sun en coreano si Charlotte sabría que Daniel estaba enamorado de ella, a lo que Sun contestó: "Es una mujer. Claro que lo sabe." Charlotte sonrió al escuchar esta conversación, sin darse cuenta de que había revelado que sabía hablar coreano.
Tras conseguir los suministros, el grupo volvió a la playa, donde Jin se enfrentó con Charlotte. Le reveló que sabía que hablaba coreano. A pesar de negarlo al principio, Charlotte acabó aceptándolo cuando Jin amenazó a Daniel. Charlotte le preguntó a Jin en coreano qué es lo que quería. Jin le dijo que se asegurara de que Sun subía al helicóptero cuando éste dejara la Isla. Ella accedió. ("Something Nice Back Home")
Al día siguiente, Frank Lapidus lanzó un teléfono satélite a la playa desde el helicóptero. El teléfono mostraba el rastro del helicóptero, y Jack y Kate creyeron que debían seguirlo. Sin embargo, antes de que partieran, Daniel llamó al helicóptero y oyó lo que pasaba al otro lado de la línea. Lo que oyó lo dejó muy inquieto. Charlotte, que se dio cuenta de que algo no iba bien, preguntó a Daniel qué ocurría. Él respondió que los mercenarios "están usando el protocolo secundario" y que tenían que salir de la isla inmediatamente. Más tarde, Daniel comenzó a transportar gente de la isla al carguero con la motora que Sayid acababa de traer a la playa. Charlotte se quedó en la orilla mirando preocupada mientras Daniel se alejaba. ("There's No Place Like Home - Part 1")
Cuando Daniel volvió para transportar un segundo grupo al carguero, le dijo a Charlotte y Miles que ellos deberían ser los siguientes. Charlotte al principio cumplió con esto, hasta que Miles le preguntó por qué estaba dispuesta a irse tan pronto, después llevar tanto tiempo intentando volver a la Isla - insinuando que ella ya había estado en la isla antes. Charlotte más tarde dijo a Daniel que no iba a volver al carguero, porque todavía "busco el lugar donde nací". Charlotte besó tiernamente a Daniel en la mejilla antes de que ambos separasen caminos. ("There's No Place Like Home - Part 2")
Charlotte estaba en el campamento de la playa cuando la luz blanca inundó la isla, y varias estructuras del campamento desaparecieron de vista. Cuando Daniel llega al campamento en la Zodiac, ella se mostró contenta, pensando que él estaba en el carguero cuando explotó, se hundió y desapareció, y los dos se abrazaron. Siguió a Daniel, que encabezaba el grupo, hasta El Cisne, para intentar analizar los acontecimientos. Charlotte mostró cólera y furia cuando Sawyer golpeó a Daniel, mostrando su preocupación por él. Más tarde, mientras conversaba con Daniel, su nariz sangró de una forma similar a como lo hizo Minkowski y Desmond cuando estaban saltando en el tiempo en "The Constant". Charlotte comentó que no le había sangrado la nariz desde que era pequeña. Daniel mostró su preocupación, interés y miedo debido a esto, pero entonces logro cubrirlo con eficacia diciendole que no le gustaba ver sangre. Daniel recomendó a Charlotte que volviese a la playa, mientras él seguía buscando su mochila en la selva. ("Because You Left")
De vuelta a la playa un par de horas más tarde, después de otro salto temporal, Charlotte abrazó a Daniel cuando reapareció diciendo que se había perdido. Esa tarde, Charlotte se le aproximó y le dio algo de fruta que había encontrado en la selva. Explicó que no se le iba el dolor de cabeza, y más preocupada estaba porque parecía estar sufriendo pérdidas de memoria; siendo incapaz de recordar el apellido de soltera de su madre desde hacía un rato. De pronto, seria, le preguntó a Daniel si sabía lo que le estaba sucediendo. Fueron interrumpidos por Miles, que había encontrado un jabalí para cenar. Más tarde, el campamento cayó bajo el ataque con flechas en llamas de un grupo desconocido. Charlotte y Daniel, yendo juntos, corrieron hasta la selva, Daniel ayudó a Charlotte cuando ella se cayó corriendo. ("The Lie")
Tras el ataque, fue a reunirse a un arroyo junto a Faraday y Miles con los demás, cuando son capturados por un grupo de Hostiles liderados por una niña llamada Ellie.Son llevados hasta el campamento de Los Otros liderados por Richard Alpert. Richard les increpó irónicamente que vienen por su "bomba" a lo que Faraday más tarde responde admitiendo que es un científico y que confiara en él, pues podía desactivar la bomba sin intentar algo contra los habitantes de la isla, pues moriría Charlotte, a quien amaba. Cuando Daniel, acompañado de Ellie, fue a desactivar la bomba denominada "Jughead" y luego de decirle que su rostro le era conocido, le dice que lo mejor sería enterrar el artefacto. Como Ellie no le cree, Daniel se ve forzado a revelar que viene del futuro junto con sus amigos. Justo en ese momento, ocurre un destello de luz, y el campamento de Richard Alpert desaparece. Sawyer, Locke, Juliet, Daniel, Miles y Charlotte se reencuentran. Daniel, notablemente feliz, le preguntó a Charlotte cómo está, y ella responde "bien" pero segundos después comienza a sangrar por la nariz y cae al suelo, bañada en sangre.("Jughead") Charlotte estuvo inconsciente más de diez minutos mientras que unos preocupados Daniel y Juliet intentaban reanimarla. Finalmente volvió en sí y al principio estaba un poco confusa, pero aparte de un dolor de cabeza dijo que se encontraba bien. Junto con el resto del grupo, volvió caminando de vuelta al campamento para recoger la zodiac para navegar por la costa de la isla y llegar a la Orquídea lo antes posible. Durante el camino, Daniel le dijo a Charlotte que podría descansar cuando llegasen a la zodiac, a lo que ella respondió: "eres muy dulce, pero no tienes que cuidarme. Estoy bien." Finalmente llegaron la playa donde se econtraron de nuevo el campamento debido a otro salto en el tiempo. Encontraron el campamento abandonado; la zodiac había desaparecido pero habían dos canoas varadas en tierra. Se echaron al mar con una de las canoas y comenzaron a navegar hacia otra parte de la isla, pero durante la travesía fueron atacados por otra canoa que empezaron a dispararles con armas de fuego. A duras penas sobrevivieron al ataque, cuando otro salto en el tiempo les llevó hasta 1988. Después del aterrizaje en otra orilla de la isla durante una violenta tormenta, Charlotte encontró algunos elementos dispersos, y un buque de vela que provenían de un reciente naufragio acaecido en la playa. ("The Little Prince")
Tras encontrarse con Jin, Charlotte y los demás siguieron hacia la Orquidea, experimentando saltos temporales cada vez con más frecuencia por el camino. Después de todos estos flashes, Charlotte se desmayó, sangrando profusamente por la nariz. Mientras Dan y los demás intentaban reanimarla, ella despertó hablando rápidamente en coreano. Entonces, en inglés, le dijo a Jin que "ella" no debía volver a la Isla porque "este sitio es la Muerte." Siguió balbuceando frases aparentemente aleatorias. Incapaz de moverse, urgió a Dan para que siguiera y acompañase al resto del grupo hasta la Orquídea. Cuando se quedaron solos, Charlotte le confesó a Daniel que se había criado en la Isla y que más tarde la abandonó junto a su madre. Pese a las afirmaciones de su madre de que la Isla era una invención de su imaginación, Charlotte creía de otra forma y se pasó la vida buscándola desde entonces. También le confió a Dan que, de niña, un hombre "loco" le había dicho que debía irse de la Isla y no volver nunca, o de lo contrario moriría. Admitió que ahora recordaba que ese hombre era Dan. Después de decir esto, Charlotte murió. ("This Place Is Death")
